Home|AllPDCS'13CC'13HPC-UA'13HPC Day'13PDCS'14HPC-UA'14HPC Day'14
HPC-UA on Facebook

Parallel and Distributed Computing Systems
Kharkiv, March 13-14, 2013

Wednesday

08:30 – 09:30

Registration

@ Foyer
09:30 – 09:40

Opening Session

@ Assembly Hall
Chair(s):
Petro Stadnik
09:40 – 13:30

Plenary Session

@ Assembly Hall
Chair(s):
Andrii Golovynskyi
09:40

High Performance Computing on GPU for Electromagnetic Logging

Vyacheslav Glinskikh

The article deals with the development of software and algorithmic techniques for multidimensional modeling and inversion of electromagnetic logs. With many new oil and gas fields being developed in difficult geological conditions, the requirements tend to be higher for reliability and efficiency of log data interpretation. Within this research various programs and algorithms were created for electromagnetic logs modeling with the use of high-performance computing on GPUs of personal computers. On the basis of approximate approaches the effective parallel algorithms for forward computing in two-dimension geoelectric models were developed. Comparative performance assessments of the diagram computations of the oil saturated reservoir are obtained on the CPU and GPU.

10:10

Supercomputers and users – management features

Sergey Zhumatiy

Supercomputers are getting common and are widely used in many areas. More and more people can use supercomputers for research, modeling, computing. But such complicated and expensive installations in most cases are not available for everyone. At the same time, if you have a supercomputer, you cannot use it all the time and with full load (in most cases). Because of that most supercomputers are used by different users or groups, sharing resources of one computer. Is it enough to install batch system and just to provide users with logins to make their work efficient and comfortable? What should administrator and supercomputer holder think about? Let\'s try to determine.

10:40

Intel® Xeon Phi™ and Intel® MPI Library

Dmitry Sivkov

Intel® Xeon Phi™ coprocessors complement Intel® Xeon processors with Many-Core highly parallel processing power. Intel(R) Cluster Studio XE gives ability to reuse same tools both for Intel® Xeon Phi™ and Intel® Xeon®.

11:10 – 11:40

Coffee Break

@ Foyer
11:40

Processing LHC data of CMS Experiment in grid infrastructure

Leonid Levchuk

Построение эффективной системы обработки экспериментальной информации явилось одной из наиболее серьезных проблем при подготовке экспериментов на Большом адронном коллайдере (БАК) в ЦЕРН. Организовано распараллеливание общего потока поступающих данных и направление их для хранения и обработки в несколько специализированных региональных центров с обеспечением эффективного и надежного доступа к этим данным при выполнении распределенных грид-вычислений.

12:10

UA-Grid: Ukrainian National Grid-Program

Leonid Belous

Доклад посвящен результатам выполнения Государственной целевой научно-технической программы "Внедрение и применение грид-технологий на 2009-2013 годы", которые вывели Украину на современный уровень использования грид-технологий,и перспективам международного сотрудничества Украины в рамках Европейской грид-инициативы (EGI) в качестве ее участника NGI_UA.

12:30

Building balanced cluster: architecture and hardware solutions

Sergii Dudinov

.

12:50

Intellection Traffic Control on Cloud

Vladimir Hahanov

A cloud on-line service “Green Wave Traffic” called the Intellectual Road Infrastructure (IRI) is proposed to monitor and control traffic in real-time mode through the use of traffic controllers, RFID cars, global satellite navigation and positioning (GPS, GPRS) in order to improve the quality and safety of vehicle movement, as well as for minimization the time and costs when vehicles are moved at the specified routes. A set of innovative scientific and technological solutions for solving social, human, economic and environmental problems associated with creation and use of a cloud for monitoring and management is developed. All of these technologies and tools are integrated into the automaton model of real-time interaction between monitoring and management clouds, vehicles and road infrastructure. Each car has a virtual model in a cyberspace - an individual cell in the cloud, which is invariant with respect to drivers of vehicles.

13:30 – 14:30

Lunch

@ ISMA Cafe
14:30 – 18:00

Architecture & System Software

@ Assembly Hall
Chair(s):
Andrii Malenko
14:30

Management of task access restrictions in multiprocessor system

Murad Agalarov

Рассматривается задача повышения эффективности работы многопроцессорной вычислительной системы путем применения в системе процедур управления доступом заданий к вычислительным ресурсам. Приведены результаты аналитического исследования и сравнительного анализа процедур доступа заданий в системе с использованием компьютерного моделирования

14:50

HPC-on-demand is the road to HPC commoditization

Dmitry Tkachev

.

15:10

Construction neuro emulators on a common microcontroller

Andriy Farenyuk

Гнучкість систем штучного інтелекту, таких як нейромережі, часто може бути корисною у автоматизованих системах управління. Однак, обчислювальної потужності таких систем, зазвичай, недостатньо для повноцінної реалізації нейроемуляторів. Нами розроблено методику вибору оптимального розміру нейромережі та параметрів її навчання для конкретної задачі, яка базується на використанні генетичних алгоритмів. Завдяки цій методиці можливим є реалізація достатньо потужних нейроемуляторів на базі мікроконтролерів споживчого рівня. Для демонстрації можливостей методики розроблено простий прилад розпізнавання кольору поверхонь за допомогою нейромереж.

15:30

On development of portable distributed computation system middleware

Andrei Zinchenko

Based of ideas of BOINC open source project, a system of distributed computations VALERIA has been developed. VALERIA middleware is suitable for deployment in scavenging or computational Grid environment. Unlike the prototypes Valeria is extremely light-weight and portable. Its node runtime does not exceed 1000 lines of C-code. The distinctive features of developed middleware are dynamic topology scan, failover procedure and automatic reconfiguration of computational resources based on keep-alive tests. The failover procedure is specially designed to be time-effective and suitable for use inside iteration of distributed PDE solvers with message passing interface.

15:50

Development of scenarios tree for research and analysis of planning in heterogeneous distributed system

Sergii Minukhin

В работе исследуется поход к организации эксперимента для исследования и анализа планирования заданий и ресурсов гетерогенной распределённой системы на основе алгоритмов метода покрытия и алгоритма FCFS. Рассмотрены основные положения подхода, проведен сравнительный анализ эффективности FCFS, эвристических и точного алгоритмов решения задачи о покрытии для решения задач планирования. Приведены результаты компьютерных экспериментов и анализ в соответствии с разработанным сценарием моделирования и анализа, использующего представление в виде дерева. Проведенный анализ обосновывает преимущества предлагаемых алгоритмов в условиях динамики изменения параметров инфраструктуры гетерогенной распределённой системы, системы планирования и заданий.

16:10 – 16:40

Coffee Break

@ Foyer
16:40

Cloud computing platform in Grid infrastructure

Vladislav Falfushinsky

В докладе предложена технология интеграции платформы облачных вычислений в грид-инфраструктуру. Представлена архитектура облачной платформы в грид, описана реализация взаимодействия между компонентами платформы и пользователями. Обоснованы основные технологические аспекты построения такого рода платформы и представлен разработанный и реализованный авторами набор необходимых команд управления. Обсуждаются вопросы внедрения платформы облачных вычислений на грид-сайтах. Описанная облачная платформа интегрирована в грид-инфраструктуру и протестирована.

17:00

Algorithms for optimization of energy consumption and processors efficiency improvement with frequency and voltage scaling in heterogeneous cluster

Maksim Sukhonos

Рассмотрены задачи повышения эффективности работы процессоров гетерогенного кластера на основе оптимизации режимов переключения частоты и напряжения для заданий с директивными сроками выполнения для приоритетного режима EDF. Приведены примеры реализации предлагаемых алгоритмов при решении задачи выбора частоты процессора. Разработано программное обеспечение для моделирования режимов переключения частот для 4- и 12-уровневых типов процессоров. Приведены результаты компьютерного моделирования предлагаемых алгоритмов, подтверждающие их преимущества по сравнению с существующими offline алгоритмами, не требующих определения точного значения частоты и напряжения процессора. Полученные результаты обосновывают возможность использования алгоритмов на практике для оптимизации энергопотребления и повышения коэффициента загрузки процессоров гетерогенного кластера.

17:20

Using the NS-3 simulator to study chaotic behavior of high-speed networks

Dmitry Gritsiv

Появление новых протоколов, приложений и сервисов, таких как GRID, протокола BitTorrent и социальных сетей, которые в значительной мере увеличивают нагрузку на каналы связи и/или предъявляют все более жесткие требования к качеству обслуживания (QoS – Quality of Service). Все эти факторы являются предпосылкой для возникновения перегрузок в компьютерных сетях. Особенно сильно свойства сетевого трафика стали проявляться с появлением технологий высокоскоростной передачи данных. Это связано с тем, что одним из основных показателей качества работы сетей с пакетной передачей является количество потерянных пакетов. Потеря пакетов приводит к дополнительной нагрузке на сеть и, в конечном счете, к «заторам». При больших скоростях передачи данных потери пакетов, выражающиеся в долях процента, приводят к значительным потерям информации. В многочисленных работах, посвященных исследованию сетевого трафика, было показано, что указанные выше явления связаны со свойствами самоподобия трафика, основной причиной которого является поведение протокола ТСР. Однако до сих пор не были предложены модели, адекватно описывающие поведение систем связи информационных систем, позволяющие применить весь арсенал классических методов анализа нелинейных динамических систем. В работе предлагается новый подход к анализу поведения сетей связи информационных систем с протоколом ТСР – рассмотрение их как нелинейных динамических систем, проявляющих хаотические свойства при определенных значениях параметров. Построены фазовые портреты исследуемой системы, рассчитаны показатели Ляпунова для различных значений основных параметров системы. Предложены рекомендации по проектированию и эксплуатации высокоскоростных оптических сетей связи информационных систем.

14:30 – 18:00

Numerical Methods

@ Small Hall
Chair(s):
Vadim Tulchinsky
14:30

Undersampling to accelerate computations

Vadim Tulchinsky

Undersampling means overcoming the Nyquist threshold. Modern Compressive Sensing theory provides general undersampling approach for data which can be represented in some domain in sparse or compressible form. Computationally complex problems frequently benefit in performance from Fourier decomposition based methods. Solution of such problems can be accelerated by decreasing the sampling rate. Undersampling application to accelerate finite-difference computations of synthetic datasets for 3D seismic surveys in elastic anisotropic geology medium with thin-layered structures and complex fracturing is described as a sample.

14:50

Asynchronous Analogs of Iterative Methods and Their Efficiency for Parallel Computers

Maksym Savchenko

This paper gives the comparison of some iterative methods (Jacobi method, Gauss–Seidel method and the Successive over-relaxation method) for solving systems of linear equations with their asynchronous implementations. Experiments show the effectiveness of asynchronous iterative methods for solving linear algebra problems on parallel multiprocessor systems.

15:10

The parallel algorithm of multi-billion atom samples generation for molecular dynamics simulations

Alex Chuprunov

The aim of our work was to build an effective parallel algorithm that can be used for generation of multi-billion atom polycrystalline samples with defects for large-scale molecular-dynamics simulations

15:30

Parallel Computation of the Functions Constructed with R-operations using CUDA

Roman Uvarov

The developed software system "AutoOmega" for automation of modeling various physical fields in two-dimensional domains of complex geometrical shapes is represented. Automation is achieved by solving the direct and inverse problems of automatic translation of geometric information into analytical and programming form, supporting the meshless natural elements method with R-functions method as well as using CUDA technology for parallel computing the single analytical function describing the geometrical object in two- and three-dimensional domains.

15:50

Exploring complex quantum systems with a hybrid CPU-GPU computing platform

Alexander Polyakov

One of the most striking features of quantum mechanics is the exponential growth of resources, required to find the states of a composite system, with the size of the system. This also is the origin of the two main bottlenecks in numerical studies of complex quantum systems, that are (i) diagonalizations of big matrices and (ii) propagations of large systems of linear differential equations with global symplectic structure. Operations of the first type are purely scalable, while most of the propagation algorithms allow for the high degree of parallelism. Here we show how the workload of finding Floquet eigenstates of an ac-driven nonlinear system can be shared between a general-purpose central processing unit (CPU) and a graphic processing unit (GPU), when both are working within one computing platform. Namely, diagonalization steps are delegated to the CPU, while the propagation is performed on the GPU. This strategy led to a computational time speed-up of several order of magnitude compared to the performance of the CPU alone.

16:10 – 16:40

Coffee Break

@ Foyer
16:40

Speed up Large Integer Multiplication Using Fourier Transforms and CUDA Technology

Hovhannes Bantikyan

Multiplying large integers is an operation that has many applications in Computational Science. Many cryptographic algorithms require operations on very large subsets of the integer numbers. Using Fast Fourier Transforms (FFT) and Graphics Processing Unit (GPU), we can speed up integer multiplication and make an e ective multiplication algorithm. CUDA technology used to perform FFT on GPU.

17:00

Mathematical modeling of quantum noise effect on the accuracy of quantum algorithms implementation

Andrey Chernyavskiy

Квантовая информатика представляет собой молодую и быстро развивающуюся область науки. Одним из наиболее перспективных направлений этой области являются квантовые компьютеры, представляющие собой принципиально новый тип высокопроизводительных устройств, которые позволят решать некоторые важные задачи, недоступные классическим компьютерам. На пути создания полномасштабного квантового компьютера лежит множество научных и технологических препятствий, для преодоления которых необходима развитая техника моделирования. Фундаментальной трудностью моделирования квантовых схем является экспоненциальный рост размерности задачи в зависимости от число квантовых битов (кубитов). Это свойство естественным образом приводит к использованию параллельных высокопроизводительных вычислений.

В работе рассмотрено моделирование квантового преобразования Фурье, а также алгоритма Гровера. Приведено описание формализма квантовых вычислений и основных приемов и трудностей моделирования. Приведены результаты моделирования многокубитных систем с учетом квантовых шумов.

18:00 – 20:00

Welcome Party

@ ISMA Cafe

Thursday

08:30 – 09:30

HPC Breakfast

@ Foyer

Perfect time to wake up, get some coffee and socialize!

09:30 – 13:30

Industrial Session

@ Assembly Hall
Chair(s):
Vladimir Shmelev
09:30

IBM Cast Iron. Better enables business agility by adding industry leading cloud integration capabilities

Andrii Vasylchenko

.

09:50

IBM Solutions for high performance computing

Andrii Lytvynenko

Обзор высокопроизводительных решений на базе линейки высокопроизводительных серверов на платформах IBM System x® и IBM POWER®.

10:10

Development of specialized computing complex for solving fluid dynamics problems "Virtual aerodynamics laboratory" on the basis of SKIT supercomputer

Andrii Golovynskyi

Перспективным путем инновационного развития высокотехнологичных отраслей Украины является внедрение современных суперкомпьютерных технологий. В последние годы стоимость и время виртуального моделирования стали ниже, чем затраты на создание и испытание соответствующего материального образца. Это достижение радикально меняет условия конкуренции в проектировании современной техники.

10:30

Flowvision CFD code innovation technologies for solving hydro- and gas dynamic problems

Vladimir Shmelev

Innovation technologies of CFD code FlowVision such as sub-grid geometry resolution, exact matching with finite-element mesh for solving fluid-structure interaction problems, client-server architecture and integration with multi criteria multi parametric optimization code IOSO are discussed in this paper.

10:50 – 11:20

Coffee Break

@ Foyer
11:20

Software system IOSO for remote parametric and optimization poroblem solving on supercomputers

Yuriy Babiy

Представлены возможности программного комплекса IOSO для организации расчетов в использованием суперкомпьютерных систем. Представлены практические примеры решения параметрических и оптимизационных задач проектирования технических систем с использованием смешанных вычислительных систем, организации облачных вычислений.

11:40

Numerical investigation of near-muzzle blast levels for perforated muzzle brake using high performance computing

Pavel Utkin

The simultaneous solution of the internal and intermediate ballistics problem is considered by the example of a cannon with muzzle gas dynamics device – perforated muzzle brake. The blast levels are obtained in the near-muzzle field. The investigations are performed by means of numerical experiments using high performance computing on cluster systems. The internal ballistics process study is based on the mathematical model of multiphase multicomponent two-velocity gas-powder continuum motion taking into account powder grains burning and force and energy inter-phase interaction. The projectile motion is described by immersed boundary method when the special source terms are included to the right-hand side of multiphase dynamics equations to model the influence of projectile boundary to the outer flow, and the calculation is performed consistently through the whole computational domain. The description of numerical algorithm parallelization is presented. Results of mathematical modeling are in good agreement with the data from natural experiments.

12:00

Mathematical models and numerical algorithm for the dynamics of gas-droplets flows investigations using high performance computing

Pavel Utkin

The paper presents the mathematical model of the dynamics of gas-droplets flows taking into account such processes as droplets evaporation, deformation and break-up. Dispersed phase of droplets description is based on the “quasi-particles” Lagrange formalism. The Dukowicz model for the droplet evaporation, TAB approach for droplet deformation and WAVE-model for droplet break-up description are used. The numerical algorithm of quasi-particles equation of motion integration is presented. The main features of parallelization technique are discussed. The special attention is paid to the consideration of numerical algorithm details connected with the description of the procedure of quasi-particle track intersection with cell face finding. Verification results of test case about water droplet motion under the action of drag and gravity forces are presented.

12:20

Methods and parallel program “FREGAT” for distributing substances in mixed cells of computational meshes

Elena Rebenok

To solve a task of substances distribution and physical values computation in mixed cells of arbitrary hexagonal meshes developed was parallel program FREGAT as a part of computer codes of 3D preprocessor in RFNC-VNIITF. The results of intersects of mesh cells with arbitrary CAD model geometry domains, where domains characterize substance, are the basis for calculating mass and volume concentrations of substances in mixed cells and other physical values. In result generated is the initial profile of mesh fields of physical values, which are transferred to be calculated to applied programs in HDF format. The paper presents results of numerical investigations at different models. Calculations were conducted in different modes with various numbers of processes.

12:40

Parallelization in the CFD-solver F when calculating three-dimensional viscous gas in multistage turbomachines

Sergiy Yershov

Статья посвящена вопросам распараллеливания вычислений при расчетах трехмерных турбулентных течений вязкого газа в многоступенчатых турбинах и компрессорах. Рассматривается CFD решатель F, предназначенный для численного интегрирования осредненных по Рейнольдсу уравнений Навье-Стокса в трехмерной расчетной области, представляющей собой проточную часть турбомашины. Распараллеливание выполнено применительно к многопроцессорным вычислительным системам с распределенной и общей памятью. Программная реализация распараллеливания использует межпроцессорный обмен информацией, построенный на основе сокет-интерфейса. Для этой цели привлекаются функции Windows Socket API. Тестирование разработанного алгоритма показало его достаточно высокую эффективность при распараллеливании задачи на 8 потоков. Рассмотрены направления дальнейшей работы по совершенствованию алгоритмов распараллеливания.

13:00

The calculation of vortex shedding flowpast of fixed and oscillating bodies

Alexey Samolysov

The work is devoted to the development and implementation in the form of complexes of programs of effective methods for simulation of flows of a viscous fluid or gas for research aerohydrodynamic loads on the body, committing arbitrary movement, including the change of the form of and for the solution of the problems of motion of bodies under the action of aerodynamic forces.

13:30 – 14:30

Lunch

@ ISMA Cafe
14:30 – 17:00

Grid & HPC in Science

@ Assembly Hall
Chair(s):
Oleksandr Sobolev
14:30

Ukrainian IT infrastructure for processing ALICE Experiment data

Oksana Shadura

.

 

14:50

Reconstruction of gene regulation networks in grid-environment with nordugrid-arc-python API

Alina Frolova

Розвиток нових технологій обумовив появу міждисциплінарної галузі в біології – системної біології, метою якої є найбільш повне системне відображення біологічних процесів на підставі аналізу величезної кількості даних. Один із підходів в цій галузі – це моделювання мережі генної регуляції, яке надає найповніше уявлення про функціонування клітин/органів і стрімко набуває поширення в медицині та біології. Моделювання передбачає поєднання високотехнологічних підходів в галузі молекулярної біології і інформатики, а саме широкомасштабного дослідження експресії генів за умов повторюваних збурень системи і моделювання мережі за використання найсучасніших методів інформаційних технологій, таких як розподілені обчислення. Оскільки сучасні алгоритми реконструкції не в змозі побудувати генні мережі з тисяч генів за прийнятний час, ми пропонуємо використання грід-технологій для вирішення цієї задачі з розробкою автоматичної системи менеджменту задач на основі nordugrid-arc-python API.

15:10

Application of HPC-technologies at B. Verkin ILTPE NAS of Ukraine

Yuri Rubin

The prospects expected from the implementation of information technologies in all realms of our life in the nearest future can scarcely be overestimated. The important role among them plays supercomputing. The calculations in such mode are being implemented at B. Verkin Institute for Low Temperature Physics and Engineering (ILTPE) of the National Academy of Sciences of Ukraine in the traditional for the institute areas of research: the physics of high-temperature superconductivity, the physics of nanocrystals, the theoretical physics, as well as in the molecular biophysics. This report presents a number of projects based on usage of HPC, being performed at ILTPE nowadays.

15:30 – 16:00

Coffee Break

@ Foyer
16:00

Ab initio calculations of electronic structure and physical properties of borides of transition and rare earth metals

Gennadiy Grechnev

С использованием модифицированного релятивистского метода линейных МТ орбиталей с полным потенциалом (FP-LMTO) а также программного комплекса Elk были исследованы электронные структуры и свойства основного состояния сложных соединений на основе бора: RNi2B2С, RB4 и M3dB50. Также были проведены самосогласованные расчеты во внешнем магнитном поле спинового и орбитального парамагнитных моментов для боридов переходных металлов, что дало возможность получить соответствующие компоненты тензора магнитной восприимчивости. На основе результатов расчетов выполнен анализ электронных состояний и взаимодействий, ответственных за структурные, электронные и магнитные свойства исследуемых боридов.

16:20

Ubiquitous computing based on open multi-agent systems: the eSocialGRIDs project

Igor Kharin

The problem of global software infrastructure for support of the distributed applications within a paradigm of ubiquitous computing has been considered. The concept and the design methods for such infrastructure on the basis of a platform for the open multi-agent environment are described consistently. Feature of the proposed solution is orientation to technology of the multi-agent systems, based on the context-sensitive organizations of agents. Taking into account dynamic character of the infrastructure for ubiquitous computing the complex of the main problems of the agent organizations in an open multi-agent environment (the relations and communication between agents, structure, tasks and behavior of multi-agent systems) is considered. It is shown that the XMPP protocol allows supporting naturally the dynamic nature of the agent organizations and dynamic nature of ubiquitous communications in the distributed open computing environment. As result of this work the architecture and basic components of the eSocialGRIDs platform for the support of ubiquitous computing within the social environment which is a union of the different communities of people and software agents are developed.

17:00 – 19:00

Bowling

@ Bowling Club "Magnit"

Enjoy Bowling competition between participants after conference closing.

Poster Session

Wednesday 10:00 – Thursday 18:00
@ Foyer
 

Industrial Approach of Application Systems Development and Implementation in the Heterogeneous Environments

Andrey Stenyashin

The description of approaches is given to the development of industry of programs production from the components of the repeated use (reuses). The theoretical and practical aspects of programs industry are offered, calculations and information. An approach to realization according to principle of co-operation of the programs and systems in modern operating environments (Corba, VS.Net, Java, Eclipse and others) is considered. The newest conceptions of technology of industrial production of the difficult programs, after which the first student factory of the programs is created in the Kiev an national university for the accumulation of knowledge’s about scientific artefacts’ and programs which are developed in diploma and master's degree works after scientific disciplines of studies, are formulated. On factories three technological lines operate in relation to presentation of reuses, programming their languages of VS.Net and study of bases of the software engineering after the textbook. To the factory 5000 users and students of other universities of higher of Ukraine and SNG appealed more.

 

On the use of parallel computing for the solver of the NP-complete problem

Anatoly Plotnikov

We discuss the use of parallel or distributed computing for realization of the heuristic algorithm of solving the maximum independent set problem,
proposed by the author in the paper ``Heuristic algorithm for finding the maximum independent set'' (the journal ``Cybernetics and Systems Analysis'': Volume 48, Issue 5 (2012), Page 673-680).

 

Mathematical model of process of the protein synthesis

Valerii Dryuma

New approach to study the system of differential equations of first order which describe process of the protein synthesis is proposed. Accurate results concerning of its solutions depending on correlations between parameters of model are obtained.

 

Adaptation of schemes for parallelization of real processes to cluster architecture

Alena Krikovluk

Пропонується один із можливих підходів до реалізації процесів направленого пошуку оптимальних рішень на кластерних архітектурах. Визначено основні принципи формування такого підходу.

 

TANDEM Program for Parallel Computing of Coupled Neutron-Physical and Thermal-Hydraulic Characteristics of Reactor Cores

Irina Silantieva

The paper describes technology which is used to provide communications in parallel reactor calculations with coupled neutron physics, thermal physics and hydraulics where it is important to take into account the feedback on temperature and density of core materials. Such calculations performed for the cores of BREST, VVER-1000 and VVER-1200 reactors demonstrate that state-of-the-art computer systems can be used to calculate the thermal-hydraulic characteristics of reactors with use of evaluted neutron data.

 

Solving nonlinear systems of equations on HPC systems using accelerators

Alla Nesterenko

В роботі розглядаються деякі підходи створення алгоритмів та програм розв'язування систем нелінійн рівнянь для комп'ютерів гібридної архітектури.

 

Solving systems of differential equations with initial conditions on HPC systems using GPU

Tetyana Gerasimova

В роботі розглядаються деякі підходи створення алгоритмів та програм розв’язування задач з початковими умовами для систем звичайних диференціальних рівнянь для комп’ютерів гібридної архітектури.

 

Cluster storage system of Institute for Condensed Matter Physics

Oleg Farenyuk

Важливою частиною обчислювальних кластерів є система збереження даних. Для кластера Інституту фізики конденсованих система НАН України (ІФКС) в ролі основи системи збереження даних було вибрано розподілену кластерну файлову систему Lustre. Ця система забезпечує високу продуктивність, при тому є гнучкою та зручною в адмініструванні. Ще однією її перевагою є повна прозорість для користувацького програмного забезпечення. Досвід інтенсивної експлуатації протягом семи років підтвердив також надійність Lustre.

 

Sensor based database security monitoring tool for distributed computing systems

Vadim Mukhin

В работе рассмотрена общая архитектура средств мониторинга безопасности баз данных в распределенных компьютерных системах на основе сенсоров. Предложен специальный механизм сенсоров для системы мониторинга безопасности, который выполняет анализ активных в данный момент процессов в базе данных и позволяет выявить подозрительные события. В результате разработан специализированный механизм поддержки мониторинга безопасности для комплексного мониторинга всех действий с базой данных, что обеспечивает дополнительную защиту от несанкционированных действий, в том числе в режиме реального времени.

 

Study of the interaction of reflex-sensor modules with enzyme subsystems for diagnosis of the human body

Pavlo Merjvinskyy

The method of using magnetic devices for diagnosis of reflex sensory subsystems of the human body makes it possible to develop and consider the basic scheme of the correction of their condition. Exploring of spatial interactions of thermo-chemical potentials of cells at diagnosis allows to take into account the main aspects of the impact of this phenomenon firstly on the field of thermo-chemical potential, and then using this information field – on the physiological system.

 

Conceptual model of ManSerIS system

Yuliya Parfenenko

This article is described conceptual model of system to work with different databases like with one instance which called ManSerIS system. ManSerIS system provides work with different kind of databases which are controlled by different database management systems. All data are stored in inner database. On logical level interaction between databases is executed by the project, which can include of different number of databases and application servers. Software model is based on client-server architecture. This model may be realized with usage object-oriented programming language Java version 6 with Enterprise Java Bean, JDBC, JSP&Servlets technology.

 

Dissemination of information in a distributed computing network

Vitaliy Ivashchenko

В данной работе представлено исследование различных вариантов распространения информации в мультиагентной вычислительной сети. С помощью имитационного моделирования исследованы различные алгоритмы поведения агентов для распространения пакета информации и проведен их сравнительный анализ. При сравнении в качестве критериев эффективности алгоритма использовались такие характеристики как скорость распространения информации, затраты ресурсов и загрузка каналов.

 

Investigation of methods location and organization distributed access to data cloud storage system of distance learning

Denis Parfenov

Every year we are seeing an increase in the number of information systems and services designed to provide interactive services for Internet users. With this you can bind a significant increase in the flow of information to be processed and data transfer over the network. Currently, for these purposes, as a rule, used rented computing power, located in the data center (DC). In this case, the actual problem is the research and development of algorithms and methods of performance management and optimization of hardware and software resources provided for the operation of services. In the framework of the present study we have constructed a model of storing and organizing shared access to data using the cloud platform used to provide access to multimedia educational resources deployed in the distance learning system.

 

A method for analyzing the behavior of formal models of distributed software systems

Alexander Kolchin

В основе предложенного метода лежит алгоритм отсечения избыточных ветвей поведения формальной модели. Факт избыточности устанавливается на основании доказательства изоморфизма графа информационных зависимостей модели. Такой подход существенно сокращает эффект "комбинаторного взрыва" количества состояний модели.

 

Safety monitoring in the cloud service of video conversion

Duc Thinh Vu

В работе рассмотрены вопросы обеспечения мониторинга безопасности ресурсов облачных систем, являющихся основой высокопроизводительных сервисов. Представлены результаты мониторинга обслуживания заявок на примере облачного сервиса конвертации видеофайлов Amazon Elastic Compute Cloud на основе open-source приложения ffmpeg и видео кодека x264, показаны графики статистики загрузки сети и процессора при работе сервиса конвертации.

 

THE CAS SYSTEM NURSE

João Oliveira

Minimally invasive surgery has become a widely used surgical technique that improves patients safety and optimizes health resources. However Computer Aided Surgery systems in their simplest form present a considerable cognitive load on the surgeon as pre-operative data cannot be displayed intra operatively. More advanced modelling and tracking techniques such as VR are typically bound to pre-operative training. We list some of the main difficulties these techniques face in an intra-operative scenario, and present an interim hardware+software solution where a new job profile the CAS system nurse can overcome many of the listed problems using our proposed system.

 

Using Cloud and Grid Technologies for Research of Smoky Plasma Physics

Dmitry Spodarets

Работа посвящена методике моделирования физических процессов в дымовой плазме с использованием облачных и грид-технологий, разработанной в Центре суперкомпьютерных вычислений и свободного программного обеспечения Одесского национального университета имени И.И. Мечникова.

 

Using SAN and clustered filesystem in the datacenter for genomic data analysis

Sergey Naumenko

Modern biomedical research requires sequencing which constantly produces terabytes of data to be processed. This advances the requirements to datacenter hardware and software. In our datacenter we use storage systems having 400TB of total capacity, computing servers and SAN infrastructure. The problem we faced was the choice of an open source clustered filesystem among RHEL GFS2 and Oracle OCFS2 (both released under GPL). In the report I will provide the general introduction to the field of genomic data analysis and bioinformatics, the description of our computer system's architecture, and, finally, our experience with GFS2/OCFS2. Our tests of performance and stability have shown that OCFS2 significanlty outperforms GFS2.

Please note! Schedule may change for some reason. Please check it now and then.

Powered by MyConf conference management system