Home|AllPDCS'13CC'13HPC-UA'13HPC Day'13PDCS'14HPC-UA'14HPC Day'14
HPC-UA on Facebook

High Performance Computing
Kyiv, October 14, 2014

Schedule

Tuesday Posters

Tuesday

09:00 – 09:40

Registration

@ Foyer
09:30 – 09:40

Opening Session

@ Assembly Hall
Chair(s):
Ivan Sergienko
09:40 – 12:30

HPC Day Industrial Session

@ Assembly Hall
Chair(s):
Volodymyr Savyak
09:40

Warm water cooling vs air cooling for supercomputing

Volodymyr Savyak.
10:10

HPC Clouds - a new hot trend or just a niche market?

Aleksey NechuyatovThere are two distinctive trends - the global adoption of additive manufacturing (3D printing) among with the "cloudisation" of IT services. Up to now on-demand HPC Cloud technology was more of a theory but that is soon to change. Massive Solutions is to present its analysis of HPC market trends and give a short overview of its Virtual Supercomputer platform, designed to bring HPC to the cloud.
10:40

New server technologies for HPC clusters

Sergii Dudinov.
11:10 – 11:40

Coffee Break

@ Foyer
11:40

Cluster room remote control and monitoring solutions

Volodymyr Osnach.
12:10

Scientific applications use case: Finding the right balance between GPU, Memory and CPU

Andrii Golovynskyi.
12:30 – 13:30

Lunch

13:30 – 17:20

Scientific Session

@ Assembly Hall
Chair(s):
Vadym Tulchynskyi
13:30

On the possibilities of using Grid as an external real-time computing device in medical imaging

Oleksandr DyominAt the present time classical Anger algorithm is used for the reconstruction of coordinates of the scintillation in commercial gamma cameras detectors. This algorithm has been proposed 60 years ago because of allowance of its implementation by analog circuits. Now all gamma cameras manufacturers have moved to digital electronic acquisition in the detectors, but this trend did not affect the reconstruction algorithm.
13:50

Study of the influence of the matrix type on the FTIR spectra of 5-bromouracil by using EGI computing resources

Yuri RubinSupercomputing (HPC - High-Perfomance Computing) with unlimited territorial access is one of the main advantages of the Grid infrastructure. Scientific calculations are carried out using HPC in B. Verkin Institute for Low Temperature Physics and Engineering (ILTPE) of the National Academy of Sciences (NAS) of Ukraine in the traditional for the institute areas of research: the physics of high-temperature superconductivity, the physics of nanocrystals, the theoretical physics, as well as in the molecular biophysics. The paper presents one of the projects carried out in ILTPE currently using HPC.With the purpose of studying of influence of type (structure) of a matrix on FTIR spectra of 5-bromuracil (5BrU) and a choice of optimum methods of calculation on polyatomic systems are carried out quantum mechanical calculations of clusters including a molecule 5-bromuracil and 32 atoms of inert gas: of neon, of argon or krypton. Results of calculation showed, in particular, that upon transition from a neon cluster to a cluster of argon or krypton occurs: low-frequency shift of stretching vibrations in a 5BrU molecule, increase of bond lengths of the exocyclic groups in this molecule, increase of interaction energy of a 5BrU molecule with an environment. It was demonstrated perspectivity of DFT method B3LYP-D functional for calculating the characteristics of large clusters of inert gases.
14:10

High performance neurocomputer architecture for combinatorical optimisation problems

Artem Potebnia

Запропоновано архітектуру новітнього нейрокомп’ютера для ефективного розв’язання задач комбінаторної оптимізації в режимі жорсткого реального часу. Висока продуктивність, компактність, надійність та енергоефективність нової платформи досягається за рахунок відтворення основних властивостей біологічних аналогів та врахування досвіду попередніх розробок. Наведено алгоритм адаптації запропонованої системи до розв’язання NP-складної задачі пошуку максимальної кліки. Сформовано підхід до масштабування нейрокомп’ютера шляхом його складання з блоків меншої розмірності. Показано, що продуктивність такої системи є сумірною з потужністю сучасних суперкомп’ютерів.

14:30

Application of rule rewriting system to software automated tuning

Pavlo Ivanenko

This paper presents a technical report on development of auto-tuning framework TuningGenie for parallel programs performance acceleration. The framework works with source code of software and performs code-to-code transformations by utilizing facilities of rule-based rewriting system. Such approach gains higher flexibility comparing to existing solutions. This paper explains the framework’s lifecycle, offers toolset for optimization, basics of architecture, and presents demo examples with results of tuning computationally complex parallel program

14:50

Parallel information technology for solving multiobjective stochastic optimization problems

Bogdan NorkinThe article describes a technique for solving multiobjective stochastic optimization problems. As a generalized model of a stochastic system to be optimized a vector "input-random output"system is used. Random outputs are converted into a vector of deterministic performance and risk indicators. The problem is to find those inputs that correspond to a Pareto-optimal values of output indicators. The problem is solved by an interactive parallel random search with a release of Pareto-optimal points. Parallel computations are used for statistical evaluation of key performance indicators, as well as to accelerate random search in the space of the system inputs. The technology uses possibility of parallel computations on multicore processors. It is possible to use a built-in hardware random number generator supporting the instruction RdRand (Intel Ivy Bridge family). When solving the most complex problems calculating is transfred to a graphic accelerator under technology NVIDIA CUDA. Using local desktop parallel computing allows efficient implementation of an interactive method for optimization of complex systems. The proposed technique is illustrated on a computer system for supporting multi-criteria optimization of the insurance business.
15:10

Harnessing database-in-memory cloud services for geophysical data processing

Vadym Tulchynskyi

Описан опыт использования облачного сервиса с базой данных в памяти (in-memory database) для ускорения работы геофизических программ. Представлена архитектура распределенной базы данных МикроПоиск на основе сервис-оринтированого подхода. Рассмотрены технические аспекты использования в этой архитектуре базы данных в памяти. Показан пример реализации облачного сервиса СУБД МикроПоиск. Обсуждаются вопросы построения облачного хранилища и удаленной работы с геофизическими данными через медленные интернет-каналы.

15:30 – 16:00

Coffee Break

@ Foyer
16:00

Intelectual supercomputing technologies in mathematical modelling

Alexandr Khimich

Ефективність застосування комп'ютерних технологій розглядається з точки зору реалізації трьох основних парадигм математичного моделювання: комп'ютерна математика, високопродуктивні обчислення і інтелектуальний інтерфейс. Реалізація цих чинників дозволить істотно перерозподілити роботи по постановці і розв'язуванню задач між користувачем і комп'ютером в порівнянні з традиційними технологіями, скоротити терміни розробки застосувань для вирішення науково-технічних задач і підвищити якість комп'ютерних рішень.

16:20

Parallel alternately-triangular method for solving algebraic problems of eigenvalues ​​for sparse matrices on computers with hybrid architecture

Oleksii Chistyakov

Комп’ютери гібридної архітектури, які поєднують обчислення на багатоядерних комп’ютерах з прискоренням обчислень на графічних процесорах, дають можливість значно прискорити процес розв’язування алгебраїчної проблеми власних значень. Проте виникають проблеми ефективної реалізації паралельних алгоритмів з урахуванням особливостей гібридного комп’ютера, а саме: необхідність у плануванні обчислень на обчислювальних ресурсах CPU і GPU, оптимізації комунікаційних витрат між ядрами CPU і процесорами GPU і т. д. В роботі розглядаються деякі підходи створення ефективних алгоритмів та програм для розв’язування алгебраїчної проблеми власних значень розріджених матриць на комп’ютерах гібридної архітектури.

16:40

Hybrid algorithm of sparce matrix LLT-factorisation

Volodymyr Sydoruk

Розглядається гібридний алгоритм розв’язування систем лінійних алгебраїчних рівнянь з розрідженими симетричними додатно-визначними матрицями на комп’ютерах з графічними прискорювачами. Проведено апробацію алгоритму на гібридному комп’ютері Інпарком-G.

17:00

Parallel Reed-Solomon Codes

Vasyl Semerenko

The compound and integrated parallel Reed-Solomon (RS) codes for multichannel communication systems are suggested. The matrix model of errors for such codes is investigated. Methods of coding and decoding of parallel RS codes, and also methods of increase of their error correcting capability are developed.

Posters

Tuesday 10:00 – Tuesday 18:00
@ Assembly Hall
 

The study of temperature effect on the structure and environment of CO2– radical in carbonate hydroxylapatite by computer modeling

Olena Kalinichenko

The type A carbonate hydroxylapatite (C-HAp) with a CO2–-radical replaced two hydroxyls in the channel (C-HAp/CO2– structure) and possible accompanying defects (a Ca2+ vacancy (□Ca) and an O–-center (a H+ vacancy) have been investigated by computer modeling using the GULP program. The most stable structures at the temperatures Т = 298, 873, 1073 and 1173 K have been established. The C-HAp/CO2– structure is the most stable at Т = 298 and 873 K. The C-HAp/{CO2– + O–} structure with the neighbouring CO2–-radical and O–-center in the channel is the most stable at higher temperatures. The temperature growth leads to noticeable changes of the CO2–-radical configuration and the nearest structural environment, in accordance with the temperature ranges of transformations of apatite structures: disappearance of □Ca at Т = 873 K results in structure ordering, removal of protons at T = 1073 and 1173 K – in appearance of oxygen ions in the channels. The obtained data complement and are in agreement with experimental and theoretical investigations of type A C-HAp. The temperature range of existence of the most stable C-HAp/{CO2– + O–} structure corresponds to EPR data about the associate forming and growth of precursor amounts of CO2–-radicals and O–-centers in type A C-HAp at these temperatures.

Please note! Schedule may change for some reason. Please check it now and then.

Powered by MyConf conference management system